黃疸是膽道閉鎖典型的症狀，然而新生兒黃疸本來就很常見，需與生理性黃疸區隔。90%的亞洲新生兒都有生理性黃疸，通常在出生後第1～3天出現、第4～5天達高峰、第7～10天逐漸下降，約2周內都會自動消失，若沒有自然消退，經藍光照射也會消退；哺餵母乳的嬰兒黃疸期可能比較長，但黃疸指數不致升太高。

若新生兒到第3、4周黃疸仍延遲不退，還有眼白變黃情形，不排除為病理性黃疸，尤其若到了30天還有黃疸情形，有很高比例可能是膽道閉鎖等肝膽疾病，必須趕快就醫檢查。

除了黃疸延遲不退，另一個重要的觀察指標是糞便顏色。國健署製發的兒童健康手冊內附「嬰兒大便卡」，可供對照。由於膽汁的顏色為黃色或綠色，若肝臟分泌的膽汁能順暢排出，和大便混合後便會呈現出黃色或綠色大便，也就是大便卡7～9號；若膽汁滯留，糞便沒有跟膽汁混合，會呈現淡黃色或灰白色，呈現大便卡編號1～6號的顏色，這屬於不正常的狀況，有膽道閉鎖的疑慮，應儘速就醫檢查。