得到幽門螺旋桿菌感染後不見得有臨床症狀，但感染者除了會造成慢性胃炎、消化性潰瘍外，也有很高的風險會引起胃癌、胃黏膜淋巴瘤。研究指出有幽門螺旋桿菌感染的人罹患胃癌的風險比沒有感染者至少高出6～9倍。

以往的治療指引曾列舉一些需要優先治療的名單，包括：消化性潰瘍、重度慢性胃炎變化、胃黏膜淋巴瘤、一等親屬內曾有胃癌病史者等。但根據2015年的京都幽門螺旋桿菌共識會議的結論，最新的建議是所有得到幽門螺旋桿菌感染的患者，都需要接受除菌治療，才不會有後續風險。