並非所有人都適合做無痛腸胃鏡，需要經過麻醉醫師評估。如上一題所述，ASA等級3以上的患者就不一定適合。這些患者通常都有較嚴重的病史，如做過重大手術後無法維持基本日常生活能力，有嚴重的心血管疾病、未經治療或危險性高的心律不整、大範圍腦中風病史、重度的慢性阻塞性呼吸道疾患、血液透析病患、控制不良的糖尿病、重度肥胖（BMI >35）或有嚴重睡眠呼吸中止症候群…等等，都需要由麻醉醫師判斷是否適合進行。

在麻醉醫師的把關之下，可以有效管控風險並且安全地進行麻醉，也因此醫師必須詳細了解病患的身體狀況。所以，麻醉前評估相當重要。病人的疾病史、手術史，目前服用的藥物、身體的症狀，都是醫師非常重視的部分，請務必詳細回答醫護人員的詢問。