（1）碳-13尿素呼氣檢查：是目前準確度最高的檢測方式，也可用來評估除菌效果，但是價格較昂貴。檢驗前，受檢測者須停用質子幫浦抑制劑（PPI）至少2周，抗生素或鉍劑則至少需停用4周。
（2）糞便抗原檢驗：準確度大約近9成，檢測費用約400∼500元，可以了解幽門桿菌感染的狀態，也可在除菌後用來評估除菌效果。
（3）血清學抗體檢驗：透過抽血檢驗幽門桿菌的抗體。不過若以前感染過，即使現在已沒有感染，幽門桿菌抗體還是會呈現陽性數年。通常10個血清學檢驗陽性者，有1∼2個可能已經未帶有幽門桿菌了，因此這種方式無法區分目前仍帶菌或曾感染過而產生抗體，所以抽血檢驗陽性者，需再以碳-13尿素呼氣檢查或糞便抗原檢驗確認是否為陽性。

除了上述非侵入性檢查外，另一個檢測是在做胃鏡檢查時可進行快速尿素?試驗（Rapid urease test, RUT或稱為CLO test），若在胃鏡檢查中發現有潰瘍病灶，即可由健保給付終生一次快速尿素酶試驗的費用。

而國健署從2024年8月起於全國10縣市試辦幽門桿菌篩檢計畫，主要針對45歲∼74歲的民眾可以終生接受一次糞便抗原檢驗。不過，目前只有與國健署合作的縣市和醫療院所才有此項篩檢服務。

如果不在篩檢試辦計畫對象中的民眾想要檢測，可以選擇自費做碳-13尿素呼氣檢查或糞便抗原檢驗；如有任何原因需要做侵入性的胃鏡檢查時，也可以告知醫師願意做切片檢測有無感染幽門桿菌。

諮詢／劉志銘（臺大醫學院內科臨床教授、臺大醫院內科部主治醫師）