C型肝炎病毒主要經過血液，透過皮膚或黏膜進入體內而傳染。
1. 與C型肝炎感染者進行不安全性行為。
2. 與C型肝炎感染者共用污染針具、注射器或接受污染之血液、血液製劑、使用滅菌不完全之器械(具)、共用沾血之個人器具(如刮鬍刀、牙刷、指甲剪、刮痧板)。
3. 經由母子垂直感染方式，機率不高，大約2∼5%。

以往，主要的感染途徑是經由輸血，但國內自1992年起，捐血中心已將C型肝炎列入篩檢項目，因輸血而感染C型肝炎的情況就幾乎不曾發生過了。近年，國內急性C型肝炎病毒透過「性行為傳染」有增加的趨勢，主要發生於男男間性行為。C型肝炎病毒的基因型突變率很高，目前仍無有效的疫苗來預防。