目前第一線治療建議使用四合一配方，包括10∼14天的鉍劑四合一或14天的非鉍劑四合一治療。克拉黴素（clarithromycin）抗藥性較低的地區，可使用14天的三合一治療作為替代療法。

不同的處方發生副作用的比例不同，也可能與個人的基因體質有關，有些人的體質對於藥物代謝比較慢，但是多數的人副作用是輕度或中度，只要停藥之後，副作用也會改善。因副作用大到無法完成整個療程的比率約為2%，並不高。

過去含鉍劑的四合一療法副作用比例普遍較高，有些人會在服藥期間出現頭暈、噁心、腹絞痛、悶痛等副作用，最近醫界調整了用藥的劑量和頻率，病人若接受含鉍劑的四合一14天療程，多數的病人都能夠順利完成服藥，療效也不錯。

而病人有時不小心漏吃藥物，不用太過擔心，若離下一次服藥還有時間，趕緊補吃，若已經要吃下一次的藥物，就順延吃下一包即可，最後只要將14天的藥物吃完就好。只要80%的藥物都在正確的時間服用，多數都會成功。